221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0753 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  410  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  60.96 
 
 
214 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  60.96 
 
 
201 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  59.89 
 
 
200 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  57.75 
 
 
201 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  59.36 
 
 
200 aa  234  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  57.75 
 
 
201 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  55.67 
 
 
216 aa  222  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  57.67 
 
 
210 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  57.67 
 
 
210 aa  222  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  56.61 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  57.07 
 
 
202 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  57.07 
 
 
202 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  53.17 
 
 
205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  53.61 
 
 
206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  58.15 
 
 
201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  56.02 
 
 
202 aa  215  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  56.08 
 
 
221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  53.61 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  52.79 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  52.48 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  53.27 
 
 
218 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  52.5 
 
 
217 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  53.12 
 
 
237 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  48.4 
 
 
219 aa  181  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  47.37 
 
 
192 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  48.15 
 
 
192 aa  175  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  51.32 
 
 
184 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  50.79 
 
 
184 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  49.74 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  43.62 
 
 
190 aa  167  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  44.15 
 
 
189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  45.99 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  45.99 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  44.92 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  45.6 
 
 
190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  42.78 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.32 
 
 
190 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  44.62 
 
 
203 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  40.82 
 
 
195 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  42.78 
 
 
189 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  42.25 
 
 
190 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  41.49 
 
 
186 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  40.91 
 
 
200 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  46.03 
 
 
186 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  42.63 
 
 
191 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  47.4 
 
 
194 aa  157  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  40.43 
 
 
208 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  43.09 
 
 
189 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  42.05 
 
 
196 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  43.01 
 
 
206 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  44.39 
 
 
188 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  42.25 
 
 
189 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  41.71 
 
 
186 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  39.9 
 
 
199 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  41.05 
 
 
185 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  41.18 
 
 
187 aa  154  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  39.89 
 
 
186 aa  154  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  43.09 
 
 
187 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  43.09 
 
 
187 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  43.62 
 
 
186 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  43.09 
 
 
200 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  40.93 
 
 
193 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  43.09 
 
 
200 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  40.64 
 
 
190 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  42.02 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  42.55 
 
 
201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  43.16 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  43.16 
 
 
211 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  40.3 
 
 
200 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  41.71 
 
 
187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  151  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  41.05 
 
 
188 aa  151  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  41.8 
 
 
186 aa  151  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  43.46 
 
 
187 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  43.46 
 
 
187 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  39.36 
 
 
185 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  43.46 
 
 
187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  43.85 
 
 
216 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  39.36 
 
 
188 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  42.33 
 
 
188 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  43.46 
 
 
187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  41.75 
 
 
187 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  41.12 
 
 
199 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  43.39 
 
 
195 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  38.39 
 
 
213 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  42.42 
 
 
200 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  42.78 
 
 
184 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  37.62 
 
 
198 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>