222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0469 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  88.89 
 
 		 189 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  88.89 
 
 		 189 aa  350  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  89.42 
 
 		 189 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  80.53 
 
 		 190 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  73.54 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  73.02 
 
 		 189 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  70 
 
 		 190 aa  280  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  70 
 
 		 190 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  70.37 
 
 		 201 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  68.21 
 
 		 173 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  52.15 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  51.06 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  50.54 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  50.54 
 
 		 192 aa  187  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  51.65 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  47.57 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  48.69 
 
 		 193 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  50.27 
 
 		 191 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  51.1 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  51.1 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  48.92 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  48.92 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  48.92 
 
 		 192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  47.85 
 
 		 207 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  51.65 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  49.46 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  46.99 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  48.91 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  48.91 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  49.73 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  49.46 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  49.74 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  50.26 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  44.21 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  45.65 
 
 		 191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  44.33 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  49.18 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  46.7 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  43.98 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  44.04 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  45.03 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  44.62 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  44.32 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  46.2 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  45.03 
 
 		 237 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  46.2 
 
 		 185 aa  164  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  46.07 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  42.55 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  43.59 
 
 		 221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  44.51 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  44.5 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  44.56 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  40.67 
 
 		 234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  42.19 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  46.7 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  44.68 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  43.72 
 
 		 190 aa  160  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  42.56 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  42.56 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.41 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  41.58 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  42.31 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  44.74 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  41.58 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  42.02 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  46.2 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  45.11 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  45.11 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  45.11 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  39.89 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.09 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  41.08 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  42.39 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  43.16 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  39.46 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.08 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  39.23 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  41.62 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>