222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0754 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  386  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  98.44 
 
 
192 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  96.88 
 
 
207 aa  383  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  96.88 
 
 
192 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  86.98 
 
 
221 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  86.98 
 
 
192 aa  349  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  85.42 
 
 
191 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  74.48 
 
 
193 aa  298  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  75 
 
 
190 aa  297  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  74.48 
 
 
193 aa  297  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  73.96 
 
 
190 aa  288  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  73.44 
 
 
190 aa  286  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  67.91 
 
 
193 aa  256  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  63.73 
 
 
200 aa  255  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  60 
 
 
200 aa  242  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  59.8 
 
 
199 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  60.11 
 
 
210 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  60.1 
 
 
199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  60.1 
 
 
199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  57.95 
 
 
195 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  60.11 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  55.4 
 
 
213 aa  231  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  56.99 
 
 
196 aa  229  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  57.29 
 
 
199 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  57.75 
 
 
185 aa  228  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  52.41 
 
 
186 aa  213  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  51.35 
 
 
186 aa  208  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  54.35 
 
 
186 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1377  hypothetical protein  56.83 
 
 
182 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  52.72 
 
 
191 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  53.89 
 
 
189 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  54.4 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  47.64 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  49.74 
 
 
191 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  48.94 
 
 
216 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  51.35 
 
 
192 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  47.37 
 
 
189 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  47.8 
 
 
188 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  47.85 
 
 
190 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  44.56 
 
 
200 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  44.57 
 
 
185 aa  184  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  48.92 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  45.86 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  48.92 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  48.13 
 
 
188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  47.85 
 
 
189 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 
203 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  47.12 
 
 
201 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  47.85 
 
 
189 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  48.63 
 
 
192 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  48.31 
 
 
173 aa  176  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  46.2 
 
 
185 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  175  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  46.2 
 
 
185 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  47.42 
 
 
192 aa  174  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  48.44 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  46.63 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  45.36 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  45.21 
 
 
187 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  44.09 
 
 
198 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  46.52 
 
 
189 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  41.94 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  44.68 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  43.48 
 
 
190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  45.65 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  45.55 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  42.47 
 
 
186 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  42.7 
 
 
208 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  42.41 
 
 
210 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  41.53 
 
 
188 aa  164  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  46.56 
 
 
219 aa  164  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  43.85 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  43.39 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  43.39 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  43.39 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  43.39 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  44.5 
 
 
205 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  42.47 
 
 
186 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  41.05 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  41.3 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  42.61 
 
 
174 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  42.33 
 
 
187 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  42.93 
 
 
211 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  42.93 
 
 
187 aa  158  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>