222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5037 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  94.74 
 
 		 190 aa  376  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  72.63 
 
 		 190 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  70 
 
 		 189 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  67.89 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  71.05 
 
 		 201 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  67.37 
 
 		 189 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  68.42 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  67.89 
 
 		 189 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  67.89 
 
 		 189 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  63.79 
 
 		 173 aa  223  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  49.73 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  47.31 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  50 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  49.18 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  47.25 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  46.2 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  46.2 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  47.25 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  43.07 
 
 		 200 aa  178  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  47.25 
 
 		 185 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  44.79 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  45.5 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  45.41 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  42.05 
 
 		 199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  46.15 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  45.36 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  47.25 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  45.7 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  46.7 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  43.48 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  46.24 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  44.02 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  44.02 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  44.02 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  46.45 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  43.78 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  43.09 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.41 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  45.16 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  45.16 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  45.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  41.15 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  43.98 
 
 		 237 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  41.49 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  43.41 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  43.32 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  41.67 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  45.16 
 
 		 192 aa  160  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  42.71 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  39.67 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  42.41 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  42.55 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  43.16 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  38.76 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  39.89 
 
 		 196 aa  158  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  42.35 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  40.43 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  40.28 
 
 		 234 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  40.66 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  38.27 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  38.27 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  43.75 
 
 		 205 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  43.23 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  42.16 
 
 		 187 aa  154  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  39.89 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  41.05 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  42.41 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  42.25 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  38.66 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  40.82 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1827  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  42.31 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  42.7 
 
 		 188 aa  151  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  38.38 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  40.32 
 
 		 187 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>