223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1153 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  59.68 
 
 		 208 aa  264  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  51.43 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  51.35 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  52.41 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  52.41 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  52.41 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  52.66 
 
 		 189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  52.88 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  51.55 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  53.55 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  50.8 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  50.54 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  50.54 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  50.54 
 
 		 187 aa  204  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  50.8 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  50.8 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  50.8 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  50.8 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  49.73 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  50.26 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  51.08 
 
 		 186 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  49.47 
 
 		 187 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  50.54 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  49.19 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  46.45 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  48.15 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  45.27 
 
 		 197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  48.15 
 
 		 187 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  45.21 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  46.15 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.74 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  48.35 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  44.68 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  45.36 
 
 		 191 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  43.24 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  46.55 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  47.09 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  44.51 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  46.45 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  45.41 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  42.39 
 
 		 192 aa  174  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  45.41 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  44.51 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  42.08 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  40.72 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  40.88 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  43.96 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  41.08 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  41.15 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  42.33 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  42.33 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  45 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.8 
 
 		 187 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.8 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.8 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  43.39 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  40.84 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  44.26 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  45.95 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  43.72 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  41.27 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  42.93 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  41.27 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  43 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  39.39 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  42.78 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  43.81 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  39.39 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  44.09 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>