223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0938 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  59.38 
 
 
191 aa  237  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  58.1 
 
 
186 aa  221  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  57.14 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  56.04 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  55 
 
 
188 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  51.93 
 
 
188 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  55.19 
 
 
201 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  53.04 
 
 
203 aa  197  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  51.38 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  51.65 
 
 
185 aa  195  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  50.54 
 
 
189 aa  193  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  51.89 
 
 
192 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  51.89 
 
 
192 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  49.74 
 
 
200 aa  193  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  51.89 
 
 
192 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  50.54 
 
 
207 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  50.54 
 
 
192 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  49.17 
 
 
188 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  51.35 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  51.35 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  51.35 
 
 
192 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  50.26 
 
 
193 aa  191  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  42.33 
 
 
234 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  51.1 
 
 
190 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  47.94 
 
 
221 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  50.28 
 
 
188 aa  190  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  49.73 
 
 
190 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  49.72 
 
 
188 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  48.91 
 
 
192 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  50 
 
 
192 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  48.63 
 
 
190 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  50.27 
 
 
189 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  48.9 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  46.99 
 
 
208 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  52.2 
 
 
189 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  48.35 
 
 
193 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  52.2 
 
 
189 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  50.28 
 
 
186 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  47.34 
 
 
193 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  52.2 
 
 
189 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  50.83 
 
 
188 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  49.73 
 
 
185 aa  185  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  48.09 
 
 
191 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  48.91 
 
 
185 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  49.45 
 
 
189 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  49.74 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  51.1 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  46.7 
 
 
190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  46.7 
 
 
190 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  47.62 
 
 
210 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  46.7 
 
 
186 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  46.24 
 
 
197 aa  178  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  46.35 
 
 
200 aa  178  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  47.59 
 
 
189 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  47.12 
 
 
199 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  45.83 
 
 
187 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  45.83 
 
 
187 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  46.81 
 
 
186 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  45.83 
 
 
187 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  46.81 
 
 
190 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  46.28 
 
 
186 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  48.07 
 
 
185 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  48.07 
 
 
185 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  53.67 
 
 
173 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  46.81 
 
 
186 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  44.62 
 
 
187 aa  174  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  47.75 
 
 
191 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.39 
 
 
198 aa  174  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  45.45 
 
 
195 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  40.96 
 
 
200 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  44.62 
 
 
187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  45.9 
 
 
184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  46.52 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  44.62 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.4 
 
 
189 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  45.55 
 
 
199 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  43.78 
 
 
187 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  44.39 
 
 
213 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  45.55 
 
 
199 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  44.09 
 
 
187 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  44.62 
 
 
187 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  44.51 
 
 
188 aa  168  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  41.95 
 
 
174 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  45.55 
 
 
199 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  43.48 
 
 
201 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  43.62 
 
 
201 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  43.01 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  43.01 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  43.01 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  43.01 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  43.55 
 
 
187 aa  164  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  43.55 
 
 
196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  41.44 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>