222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0705 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  70.77 
 
 		 193 aa  292  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  68.02 
 
 		 190 aa  274  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  68.02 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  68.02 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  65.66 
 
 		 193 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  65.66 
 
 		 193 aa  267  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  62.12 
 
 		 191 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  64.77 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  64.77 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  64.77 
 
 		 192 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  64.25 
 
 		 192 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  64.25 
 
 		 192 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  63.64 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  64.25 
 
 		 192 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  63.21 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  62.12 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  64.68 
 
 		 199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  61.62 
 
 		 207 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  64.53 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  64.53 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  63.21 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  61.62 
 
 		 192 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  62.69 
 
 		 195 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  61.5 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  59.41 
 
 		 210 aa  242  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  58.76 
 
 		 196 aa  241  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  61.14 
 
 		 199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  58.29 
 
 		 214 aa  229  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1377  hypothetical protein  62.5 
 
 		 182 aa  222  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  53.61 
 
 		 185 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  49.49 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  49.74 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  48.73 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  49.74 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  47.24 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  47.42 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  46.97 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  46.97 
 
 		 191 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  44.9 
 
 		 186 aa  187  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  47.15 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  47.29 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  47.29 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  49.26 
 
 		 192 aa  184  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  43.78 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  44.85 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  45.18 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  43.65 
 
 		 188 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.81 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.07 
 
 		 190 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  44.78 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  42.63 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  47.31 
 
 		 173 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  42.08 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  46.63 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  43.01 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  43.84 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  45.83 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  44.33 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  43.2 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  44.22 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  44.22 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  43.72 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  45.5 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  44.86 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  44.85 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  44.33 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  41.95 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  44.85 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  42.93 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  39.58 
 
 		 181 aa  167  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  43.65 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  43.65 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  43.65 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  46.04 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  42.13 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  41.97 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  42.16 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  43 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  43.5 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  43 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  43.72 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  43.72 
 
 		 216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  42.71 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  39.06 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  42.5 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  43.37 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  45 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  40.7 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  41.5 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>