223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3962 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  70.26 
 
 		 200 aa  288  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  68.98 
 
 		 190 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  66.31 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  67.91 
 
 		 193 aa  263  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  67.38 
 
 		 193 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  68.45 
 
 		 192 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  68.45 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  68.45 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  68.45 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  67.91 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  67.91 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  66.84 
 
 		 207 aa  255  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  64.43 
 
 		 195 aa  255  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  63.78 
 
 		 199 aa  254  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  64.89 
 
 		 221 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  64.89 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  62.89 
 
 		 191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  66.31 
 
 		 192 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  63.02 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  63.02 
 
 		 199 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  63.78 
 
 		 200 aa  251  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  60.56 
 
 		 213 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  61.58 
 
 		 196 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  59.69 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  58.33 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1377  hypothetical protein  62.64 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  59.38 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  57.22 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  53.48 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  53.4 
 
 		 191 aa  203  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  52.69 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  48.68 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  49.21 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  48.7 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  50.26 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  49.2 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  46.91 
 
 		 203 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  49.19 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  52.06 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  44.56 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  48.65 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  51.03 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  49.2 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  47.34 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  49.46 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  45.36 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  49.73 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  46.77 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  48.45 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  48.39 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.85 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  45.16 
 
 		 187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  46.24 
 
 		 192 aa  170  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  45.7 
 
 		 190 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  47.06 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  48.45 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  43.23 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  46.77 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  43.94 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  47.62 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  47.62 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  47.62 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  46.11 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  46.77 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  44.62 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.78 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  49.72 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  42.16 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  48.15 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  43.75 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  46.11 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  41.4 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  45.08 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  43.23 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  44.5 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  43.23 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  43.3 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  45.41 
 
 		 206 aa  164  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  39.91 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  46 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  44.79 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  45.31 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  44.44 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  46.11 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  41.54 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  42.71 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.88 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  44.39 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.88 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.88 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>