223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5045 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  96.83 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  96.83 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  89.42 
 
 		 189 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  76.84 
 
 		 190 aa  295  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  69.84 
 
 		 189 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  68.78 
 
 		 189 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  68.42 
 
 		 190 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  68.95 
 
 		 190 aa  270  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  67.72 
 
 		 201 aa  259  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  68.21 
 
 		 173 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  52.15 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  50.8 
 
 		 190 aa  187  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  52.72 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  52.2 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  49.47 
 
 		 193 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  50.27 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  50.27 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  50.55 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  50.27 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  51.35 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  47.57 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  46.99 
 
 		 188 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  48.11 
 
 		 207 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  50.54 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  48.39 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  50.54 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  49.46 
 
 		 191 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  47.85 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  47.57 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  48.65 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 		 203 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  44.74 
 
 		 187 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  43.35 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  48.39 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  45.41 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  47.62 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  47.25 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  48.66 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  46.07 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  44.04 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  48.15 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  42.86 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  41.88 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.81 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  41.49 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  44.32 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  43.48 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  45.6 
 
 		 205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  43.78 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  45.03 
 
 		 206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  42.5 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  43.62 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  42.93 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  45.03 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  44.92 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  42.11 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  44.1 
 
 		 221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  45.21 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  45.95 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  44.56 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  42.02 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  44.5 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  44.26 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.96 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  45.31 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  39.91 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  41.33 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  45.55 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  43.08 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42.56 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  43.68 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  44.51 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  43.08 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.62 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  42.55 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  42.27 
 
 		 213 aa  157  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  42.25 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  45.65 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.08 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  45.11 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  45.05 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  44.62 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  44.51 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>