222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0681 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  55.96 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  57.73 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  57.73 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  56.16 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  58.42 
 
 		 213 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  55.96 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  55.96 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  55.61 
 
 		 210 aa  220  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  55.38 
 
 		 216 aa  220  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  54.29 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  55.79 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  52 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  54.92 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  54.92 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  54.92 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  53.23 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  54.45 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  51.58 
 
 		 195 aa  191  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  47.69 
 
 		 201 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  50.26 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  48.22 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  46.94 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  47.17 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  49.21 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  48.92 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  48.39 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  48.92 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  47.21 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  48.66 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  47.34 
 
 		 199 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  46.24 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  47.87 
 
 		 190 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  45.21 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  45.21 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  45.21 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  44.68 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  43.68 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  44.62 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  43.62 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  47.4 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  44.97 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  43.37 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  44.97 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  43.37 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  43.37 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  46.24 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  42.25 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  39.51 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  43.39 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  45.21 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  45.16 
 
 		 190 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  43.62 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  46.88 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  43.62 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  43.78 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  42.78 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  38.6 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  41.18 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  42.55 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  42.35 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  42.78 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  40.64 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  40.64 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  44.44 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  40.64 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  41.27 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  40.31 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>