222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0999 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  99.46 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  95.11 
 
 		 197 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  57.38 
 
 		 192 aa  210  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  53.8 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  52.97 
 
 		 190 aa  199  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  49.74 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  49.21 
 
 		 217 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  48.68 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  49.21 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  48.9 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  49.21 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  48.69 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  47.62 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  48.68 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  47.83 
 
 		 206 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  48.68 
 
 		 205 aa  180  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  48.92 
 
 		 205 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  51.6 
 
 		 214 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  49.21 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  50.26 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  47.09 
 
 		 210 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  50.79 
 
 		 202 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  49.74 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  47.62 
 
 		 201 aa  174  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  45.5 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  45.05 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  48.17 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  46.35 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  46.35 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  46.35 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  46.45 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  46.03 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  43.48 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  43.09 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  44.15 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  44.97 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  43.09 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  44.15 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  43.09 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  44.15 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  43.62 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  43.62 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  43.68 
 
 		 200 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  45.21 
 
 		 212 aa  156  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  44.68 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.81 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  44.09 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  40.43 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  41.49 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  41.62 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.58 
 
 		 189 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  43.55 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  41.94 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  42.02 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  45.11 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  41.8 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  42.62 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  43.92 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  42.93 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  42.08 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  40.72 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  40.96 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  39.78 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  39.56 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  41.3 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  42.62 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  43.32 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  40.51 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  40.93 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  41.08 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  40.32 
 
 		 207 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  42.39 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  38.83 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  39.25 
 
 		 191 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  38.92 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 190 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  40.86 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  40.86 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  39.34 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  39.68 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  39.78 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>