208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2895 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  46.99 
 
 		 219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  46.07 
 
 		 192 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  45.95 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  47.4 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  47.47 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  47.47 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  45.32 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  46.6 
 
 		 218 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  48.17 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  43.94 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  47.15 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  45.11 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  45.08 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  47.12 
 
 		 213 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  44.57 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  44.74 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  46.5 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  47.15 
 
 		 216 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  46.67 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  44.97 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  44.56 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  44.97 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  43.48 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  45.03 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  46.07 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  42.33 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  44.97 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  45.21 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  43.75 
 
 		 201 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  42.63 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  41.12 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  43.16 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  42.11 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  41.49 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  40.86 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  39.89 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  40.86 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  37.44 
 
 		 197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  40.43 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  40.43 
 
 		 211 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  40.43 
 
 		 211 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  42.33 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  40.74 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  41.8 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  39.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  39.89 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  40.43 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  39.9 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  37.43 
 
 		 186 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  40.86 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  38.14 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  39.89 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  40.86 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  38.3 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  38.92 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  38.3 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  39.06 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  42.16 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  40.86 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  40.86 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  38.3 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  37.77 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  39.59 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  39.36 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  39.06 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  39.06 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  39.06 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  39.06 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  41.15 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  37.82 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  38.34 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  38.34 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  38.34 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  39.36 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  40.54 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  38.1 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  39.46 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  38.83 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  37.82 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>