222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3343 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  98.93 
 
 
187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  99.47 
 
 
187 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  98.93 
 
 
187 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  91.98 
 
 
211 aa  361  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  91.98 
 
 
211 aa  361  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  91.98 
 
 
187 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  91.44 
 
 
187 aa  360  9e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  88.24 
 
 
212 aa  338  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  72.19 
 
 
197 aa  293  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  70.59 
 
 
187 aa  283  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  69.52 
 
 
187 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  70.05 
 
 
187 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  71.66 
 
 
187 aa  274  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  70.05 
 
 
187 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  70.05 
 
 
187 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  70.05 
 
 
187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  59.89 
 
 
187 aa  239  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  49.47 
 
 
189 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  48.94 
 
 
200 aa  205  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  47.87 
 
 
187 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  51.08 
 
 
186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  46.77 
 
 
187 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  46.77 
 
 
187 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  46.77 
 
 
187 aa  197  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  45.7 
 
 
187 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  47.31 
 
 
200 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  47.31 
 
 
200 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  47.31 
 
 
187 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  47.31 
 
 
187 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  48.57 
 
 
174 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  45.7 
 
 
186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  46.24 
 
 
186 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  44.09 
 
 
185 aa  187  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  47.85 
 
 
191 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  47.03 
 
 
187 aa  187  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  45.16 
 
 
186 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  46.77 
 
 
187 aa  185  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.01 
 
 
208 aa  184  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  47.57 
 
 
191 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.99 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  44.08 
 
 
234 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  46.03 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  47.06 
 
 
186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  45.95 
 
 
188 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  44.62 
 
 
188 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  45.45 
 
 
216 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  45.18 
 
 
200 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  44.62 
 
 
190 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  44.79 
 
 
196 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  46.94 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  43.01 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  43.01 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  42.38 
 
 
213 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  46.24 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  48.11 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.33 
 
 
198 aa  170  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  44.39 
 
 
199 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  45.16 
 
 
187 aa  169  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  44.39 
 
 
199 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  41.71 
 
 
186 aa  169  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  42.47 
 
 
184 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  43.72 
 
 
199 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  168  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  43.62 
 
 
197 aa  168  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  43.78 
 
 
188 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  41.27 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  42.55 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  43.85 
 
 
193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  43.32 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  40.74 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  42.93 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0009  hypothetical protein  45.51 
 
 
187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  42.47 
 
 
192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  41.88 
 
 
193 aa  161  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  43.01 
 
 
201 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  42.25 
 
 
185 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  44.15 
 
 
197 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  43.78 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  44.15 
 
 
184 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  43.62 
 
 
184 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  43.85 
 
 
189 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  42.16 
 
 
190 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  157  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  40.64 
 
 
190 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  41.88 
 
 
207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  41.88 
 
 
192 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>