222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6268 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  93.33 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  79.1 
 
 		 213 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  78.42 
 
 		 202 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  78.42 
 
 		 202 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  76.26 
 
 		 202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  68.47 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  68.37 
 
 		 217 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  64.59 
 
 		 216 aa  278  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  64.15 
 
 		 218 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  68.42 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  67.53 
 
 		 205 aa  274  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  65.13 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  68.42 
 
 		 221 aa  271  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  64.8 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  64.47 
 
 		 206 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  56.02 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  56.54 
 
 		 201 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  57.07 
 
 		 201 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  57.67 
 
 		 202 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  55.61 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  53.23 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  52.74 
 
 		 200 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  52.76 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  54.45 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  52.38 
 
 		 192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  50.26 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  49.21 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  48.42 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  49.21 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  48.69 
 
 		 184 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  48.95 
 
 		 195 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  47.09 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  47.64 
 
 		 190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  43.63 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  43.9 
 
 		 200 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  41.46 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  43.37 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  42.21 
 
 		 195 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  43.37 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.86 
 
 		 193 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  43.92 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  41.05 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  44.44 
 
 		 193 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  43.3 
 
 		 193 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  44.21 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  42.86 
 
 		 189 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  43.92 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  41.58 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  41.58 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  41.58 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  41.05 
 
 		 192 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  42.11 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  40.53 
 
 		 192 aa  160  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  40.74 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  44.55 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  42.86 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  42.35 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  41.84 
 
 		 196 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  43.23 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  41.84 
 
 		 189 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  42.33 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  43.39 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  41.75 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  40.09 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  43.39 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.27 
 
 		 185 aa  156  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  46.07 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  41.87 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  41.71 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  39.63 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  41.71 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  40.82 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  43.01 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  40.93 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  39.79 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  40.53 
 
 		 189 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  43.01 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  39.27 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  42.13 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  39.27 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  42.86 
 
 		 185 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  39.27 
 
 		 211 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>