221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4491 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  49.46 
 
 
195 aa  184  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  48.19 
 
 
217 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  48.44 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  48.69 
 
 
218 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  46.83 
 
 
216 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  47.92 
 
 
221 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  46.5 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  45.63 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  46.45 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  47.34 
 
 
205 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  50 
 
 
192 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  47.4 
 
 
213 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  44.66 
 
 
205 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  47 
 
 
206 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  46.45 
 
 
184 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  45.9 
 
 
184 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  47.72 
 
 
202 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  45.08 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  47.67 
 
 
213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  45.95 
 
 
219 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  46.52 
 
 
187 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  46.7 
 
 
201 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  45.54 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  45.54 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  45.45 
 
 
187 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  45.45 
 
 
214 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  46.07 
 
 
210 aa  154  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  45.21 
 
 
200 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  45.21 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  44.79 
 
 
210 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  45.21 
 
 
187 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  45.21 
 
 
200 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  42.44 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  43.78 
 
 
185 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  42.44 
 
 
200 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  45.7 
 
 
186 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  46.11 
 
 
201 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  44.62 
 
 
201 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  44.39 
 
 
187 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  43.24 
 
 
190 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 
189 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  42.39 
 
 
192 aa  147  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  38.42 
 
 
187 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  38.42 
 
 
187 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  44.27 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  41.53 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  41.94 
 
 
186 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  47.21 
 
 
201 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  37.89 
 
 
187 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  41.08 
 
 
191 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  42.02 
 
 
190 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  41.4 
 
 
186 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  40.31 
 
 
214 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  44.68 
 
 
192 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  42.02 
 
 
188 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  40.96 
 
 
186 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  43.32 
 
 
188 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  43.01 
 
 
186 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  39.7 
 
 
216 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  40.76 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  41.3 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  38.46 
 
 
203 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  37.57 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  38.95 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  38.95 
 
 
211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  40.74 
 
 
189 aa  138  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  38.92 
 
 
208 aa  137  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  39.36 
 
 
212 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  37.25 
 
 
200 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  40.5 
 
 
199 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  38.83 
 
 
187 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  36.84 
 
 
197 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  40.1 
 
 
193 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  38.3 
 
 
187 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  36.7 
 
 
187 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  38.3 
 
 
187 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  37.14 
 
 
234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  37.63 
 
 
187 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  37.89 
 
 
187 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>