221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3059 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  55.74 
 
 		 192 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  51.79 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  52.58 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  52.11 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  52.11 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  51.56 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  50.77 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  49.75 
 
 		 205 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  51.31 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  50.52 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  50.53 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  50.53 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  50.26 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  45.6 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  47.74 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  47.76 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  48.45 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  48.45 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  50.26 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  46.39 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  49.74 
 
 		 192 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  49.45 
 
 		 184 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  48.9 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  48.35 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  51.35 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  48.4 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  48.07 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  46.27 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  49.18 
 
 		 186 aa  175  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  45.64 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  45.88 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  45.6 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  45.95 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  43.41 
 
 		 186 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  45.86 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  46.99 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  46.56 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  46.7 
 
 		 186 aa  164  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  47.06 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  47.06 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  47.06 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  46.15 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  46.52 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  44.02 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  46.2 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  46.56 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  47.28 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  46.49 
 
 		 191 aa  161  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  43.92 
 
 		 189 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  46.74 
 
 		 193 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  45.95 
 
 		 199 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  46.15 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  45.99 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  41.08 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  45.11 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  44 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  43.39 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  45.11 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  44.75 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  44.75 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  47.31 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  47.31 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  45.36 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  45.6 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  44.32 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  43.41 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  43.72 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.94 
 
 		 189 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  46.03 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  40.54 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  43.78 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  45.3 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  43.78 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  41.44 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  44.26 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  42.11 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  46.07 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  43.24 
 
 		 190 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 214 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  43.78 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  43.24 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  37.07 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  151  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  37.07 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>