222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0436 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  55.68 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  52.97 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  52.43 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  52.97 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  53.44 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  51.35 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  184  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  50.26 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  49.74 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  48.98 
 
 		 237 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  50 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  48.45 
 
 		 205 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  48.22 
 
 		 218 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  49.74 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  48.69 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  46.39 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  47.64 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  46.11 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  44.74 
 
 		 189 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  47.87 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  45.26 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  44.16 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  44.16 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  45.11 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  45.55 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  46.07 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  47.12 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  46.84 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  45.6 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  47.12 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  44.04 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  43.39 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  46.24 
 
 		 191 aa  160  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  43.92 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  41.67 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  46.6 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  45.26 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  45.7 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  45.88 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  45.7 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  45.88 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  43.98 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  42.93 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  46.56 
 
 		 193 aa  157  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  41.8 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  43.46 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  46.24 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  44.38 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  43.46 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  43.39 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  42.86 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  44.74 
 
 		 190 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  45.7 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  45.08 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  45.08 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  44.74 
 
 		 190 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.49 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  44.62 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  42.41 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  44.79 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  42.47 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  40.84 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  40.84 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  42.47 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  42.47 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  40.74 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  43.24 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  42.93 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  40.74 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  44.74 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  40.21 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0539  hypothetical protein  40.54 
 
 		 188 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  43.01 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  38.74 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>