222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4348 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  84.81 
 
 		 218 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  81.86 
 
 		 217 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  83.66 
 
 		 213 aa  348  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  76.06 
 
 		 216 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  82.2 
 
 		 221 aa  334  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  71.36 
 
 		 216 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  71.2 
 
 		 205 aa  300  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  69.27 
 
 		 205 aa  284  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  68.42 
 
 		 210 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  66.84 
 
 		 206 aa  274  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  68.23 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  63.16 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  59.69 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  59.69 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  59.16 
 
 		 202 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  57.73 
 
 		 205 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  54.59 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  55.61 
 
 		 200 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  55.15 
 
 		 214 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  55.1 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  54.74 
 
 		 201 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  52.63 
 
 		 201 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  53.12 
 
 		 202 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  52.11 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  52.38 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  52.11 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  50.26 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  49.74 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  49.21 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  50.52 
 
 		 195 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  51.58 
 
 		 192 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  48.44 
 
 		 199 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  49.21 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  48.98 
 
 		 190 aa  178  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  45.03 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  42.16 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  44.04 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  45.31 
 
 		 193 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  45.03 
 
 		 189 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  45.55 
 
 		 189 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  45.55 
 
 		 189 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  43.98 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0485  hypothetical protein  43.98 
 
 		 190 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  41.26 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  43.15 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  42.42 
 
 		 199 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  43.15 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  44.44 
 
 		 186 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  44.27 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  43.01 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  42.64 
 
 		 199 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  43.68 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  43.68 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  43.68 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  43.92 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  42.86 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  43.16 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  41.88 
 
 		 189 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  44.21 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  41.88 
 
 		 189 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  39.34 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  42.93 
 
 		 196 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  44.44 
 
 		 190 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.35 
 
 		 198 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  44.21 
 
 		 192 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  43.39 
 
 		 187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  43.39 
 
 		 187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  43.39 
 
 		 187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  41.41 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  42.63 
 
 		 192 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  43.92 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  42.41 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  43.98 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  41.88 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  40.82 
 
 		 192 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  42.33 
 
 		 193 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  42.33 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  43.98 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  39.79 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  44.56 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  41.27 
 
 		 186 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  43.39 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  43.39 
 
 		 188 aa  148  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  42.33 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  42.33 
 
 		 187 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  42.33 
 
 		 200 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  42.33 
 
 		 187 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2895  protein of unknown function DUF179  44.44 
 
 		 194 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0104323  normal  0.0123149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>