219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0683 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  59.68 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  55.8 
 
 		 214 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  46.7 
 
 		 219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  44.85 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  44.39 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  45.9 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  44.26 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  42.63 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  43.62 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  41.62 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  41.62 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  41.84 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  43.72 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  42.08 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  43.41 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6966  hypothetical protein  42.63 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  42.71 
 
 		 210 aa  147  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  40.41 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  42.27 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3550  hypothetical protein  41.97 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.749853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  42.31 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  42.31 
 
 		 190 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  38.1 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  41.76 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  42.31 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  40.84 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  38.71 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0480  hypothetical protein  40.41 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1574  hypothetical protein  42.62 
 
 		 184 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  40.96 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  39.9 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  42.39 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  41.85 
 
 		 184 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  41.62 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2594  hypothetical protein  40.62 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  40.11 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  40.31 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0485  hypothetical protein  39.9 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2752  hypothetical protein  40.41 
 
 		 221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  40.76 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  41.05 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  38.25 
 
 		 197 aa  137  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  37.02 
 
 		 234 aa  137  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  44.12 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0835  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186487  hitchhiker  0.000370502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  40.22 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  40 
 
 		 218 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0382  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0864  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  42.11 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  38.29 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  38.71 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3962  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  39.34 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  41.58 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0737  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0754  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173115  normal  0.270249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  40.86 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  40.76 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  36.56 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  39.56 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  39.67 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  39.67 
 
 		 221 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  39.89 
 
 		 216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  36.22 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  40.53 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  36.02 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  36.22 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  36.22 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0264  protein of unknown function DUF179  39.58 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  40.22 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  34.59 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  40.22 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  35.68 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  39.56 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  38.3 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  39.57 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  35.68 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  39.67 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  37.17 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>