220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0165 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0165  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.197287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2673  hypothetical protein  57.61 
 
 
186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0683  hypothetical protein  55.8 
 
 
186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  41.84 
 
 
216 aa  157  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3083  protein of unknown function DUF179  44.51 
 
 
192 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0309575  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  41.4 
 
 
189 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  45.7 
 
 
186 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  39.56 
 
 
197 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3059  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00598781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  40.64 
 
 
188 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  42.08 
 
 
191 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  43.41 
 
 
206 aa  148  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  43.62 
 
 
205 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2624  protein of unknown function DUF179  39.02 
 
 
202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  45.65 
 
 
188 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  40.31 
 
 
199 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  40.22 
 
 
195 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  41.71 
 
 
174 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  42.41 
 
 
190 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  43.58 
 
 
188 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  43.02 
 
 
192 aa  142  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  37.91 
 
 
187 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  39.23 
 
 
187 aa  141  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  39.23 
 
 
187 aa  141  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2596  hypothetical protein  37.98 
 
 
202 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  45.11 
 
 
188 aa  141  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2819  protein of unknown function DUF179  37.98 
 
 
202 aa  141  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.227071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  39.25 
 
 
200 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  37.91 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0659  hypothetical protein  39.15 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  39.27 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  41.53 
 
 
184 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  38.42 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  40.98 
 
 
184 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  38.95 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  38.67 
 
 
187 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  43.98 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  40.85 
 
 
187 aa  138  7.999999999999999e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3352  hypothetical protein  38.86 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0115365  decreased coverage  0.00224252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  39.89 
 
 
197 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  37.36 
 
 
211 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  38.17 
 
 
190 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  37.36 
 
 
211 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  39.15 
 
 
189 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  41.01 
 
 
192 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1255  protein of unknown function DUF179  40.8 
 
 
206 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  38.01 
 
 
187 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  40.66 
 
 
186 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  40.21 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  38.82 
 
 
187 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  42.39 
 
 
184 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3335  hypothetical protein  38.82 
 
 
187 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.288189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 
189 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  37.97 
 
 
189 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  38.24 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  38.24 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  37.91 
 
 
190 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  38.24 
 
 
187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  38.62 
 
 
189 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  36.04 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  37.17 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  37.91 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  37.43 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  39.38 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  38.59 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  37.43 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03150  hypothetical protein  41.71 
 
 
173 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  36.26 
 
 
187 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0243  hypothetical protein  37.23 
 
 
210 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.763394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3917  hypothetical protein  38.14 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0364734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  36.02 
 
 
187 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  38.74 
 
 
191 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  40.11 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  35.71 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  35.45 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6268  hypothetical protein  37.68 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.383786  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  40.96 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0617  hypothetical protein  39.68 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559963  normal  0.877455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  36.27 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  36.81 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  38.46 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  36.27 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0595  hypothetical protein  37.57 
 
 
214 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>