222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0940 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  75.4 
 
 
188 aa  288  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  66.31 
 
 
188 aa  257  9e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  65.24 
 
 
188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  52.75 
 
 
186 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  50.56 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  49.17 
 
 
192 aa  192  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 
203 aa  188  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  47.25 
 
 
208 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  46.45 
 
 
216 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  44.02 
 
 
187 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  45.9 
 
 
190 aa  178  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1252  hypothetical protein  41.83 
 
 
234 aa  177  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  45.11 
 
 
189 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3764  hypothetical protein  47.83 
 
 
188 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  46.11 
 
 
191 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  45.9 
 
 
186 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1578  hypothetical protein  43.75 
 
 
199 aa  174  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.663829 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  46.67 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  44.57 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  44.32 
 
 
191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0058  hypothetical protein  46.15 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  42.86 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2896  protein of unknown function DUF179  42.19 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3573  hypothetical protein  42.19 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.425942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1517  hypothetical protein  42.41 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  41.76 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  45.95 
 
 
189 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  43.01 
 
 
190 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  43.72 
 
 
193 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0501  hypothetical protein  41.62 
 
 
187 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  44.26 
 
 
193 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2478  hypothetical protein  43.33 
 
 
186 aa  168  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  41.21 
 
 
187 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  45.41 
 
 
189 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  43.41 
 
 
186 aa  167  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  45.65 
 
 
187 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  43.65 
 
 
190 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  43.65 
 
 
190 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  41.15 
 
 
199 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  41.62 
 
 
200 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  44.26 
 
 
221 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  44.26 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  45.41 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  45.41 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  45.41 
 
 
187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  39.68 
 
 
197 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  43.65 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  43.41 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1142  hypothetical protein  41.4 
 
 
195 aa  164  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.873097  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  41.45 
 
 
200 aa  164  8e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  42.7 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2579  hypothetical protein  41.99 
 
 
185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0876832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  44.02 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  42.16 
 
 
193 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0907  hypothetical protein  39.61 
 
 
213 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572934  normal  0.591231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  45.11 
 
 
187 aa  162  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  43.24 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  43.24 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  160  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2850  hypothetical protein  43.17 
 
 
186 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  160  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  40.54 
 
 
189 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  43.17 
 
 
192 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  43.32 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  42.62 
 
 
207 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  43.32 
 
 
189 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0057  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 
187 aa  158  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0062  hypothetical protein  40.86 
 
 
187 aa  158  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.492271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0747  protein of unknown function DUF179  41.08 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3439  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.623694  hitchhiker  0.00691193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  40 
 
 
194 aa  158  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0766  hypothetical protein  41.08 
 
 
211 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155835  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  42.86 
 
 
191 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3259  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0107487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  43.78 
 
 
187 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  42.47 
 
 
190 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3177  hypothetical protein  43.78 
 
 
187 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000779638  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3034  hypothetical protein  43.78 
 
 
200 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3019  hypothetical protein  43.78 
 
 
200 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00383877  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02778  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.551052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3106  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4251  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.390045  normal  0.313475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3270  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.552102  normal  0.0744312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3291  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3380  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02741  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3348  hypothetical protein  39.27 
 
 
196 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.142843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3090  hypothetical protein  41.08 
 
 
187 aa  157  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132976  decreased coverage  0.00000221223 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3343  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.329323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>