More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0835 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0835  ABC transporter related  100 
 
 
273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0268  ABC transporter related  86.67 
 
 
277 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1187  ABC transporter related  65.61 
 
 
256 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3746  ABC transporter related  64.29 
 
 
272 aa  349  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3784  ABC transporter related  58.96 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.15686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3866  ABC transporter related  55.26 
 
 
278 aa  314  8e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0935  ABC transporter related  55.77 
 
 
278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  37.93 
 
 
288 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
281 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  36.33 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  38.79 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  37.71 
 
 
267 aa  171  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
264 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  37.55 
 
 
273 aa  168  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  41.58 
 
 
353 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
308 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
267 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 
254 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  40 
 
 
259 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  38.96 
 
 
260 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.02 
 
 
352 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.1 
 
 
353 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  35.68 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.1 
 
 
353 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  35.38 
 
 
290 aa  165  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  37.08 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  36.1 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  39.44 
 
 
255 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  35 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  40.18 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  38.01 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  36.03 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
261 aa  162  6e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  37.98 
 
 
329 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
353 aa  162  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  37.74 
 
 
304 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  38.02 
 
 
283 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  36.77 
 
 
399 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  37.02 
 
 
329 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  36.29 
 
 
262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  36.29 
 
 
262 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 
368 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 
370 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 
267 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  39.04 
 
 
255 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  33.48 
 
 
258 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
378 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  37.26 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  36.36 
 
 
371 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  36.95 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
353 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.33 
 
 
367 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  34.85 
 
 
271 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  38.16 
 
 
258 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
275 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  37.76 
 
 
255 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  35.68 
 
 
283 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.54 
 
 
329 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 
253 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  37.17 
 
 
269 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  35.5 
 
 
303 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
353 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 
271 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  34.22 
 
 
255 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  34.44 
 
 
306 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 
255 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.32 
 
 
252 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.53 
 
 
413 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  37.66 
 
 
289 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  37.89 
 
 
287 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  37.69 
 
 
255 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  37.69 
 
 
255 aa  158  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  35.19 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  37.69 
 
 
255 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  35.06 
 
 
262 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  34.58 
 
 
303 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  38.13 
 
 
265 aa  158  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  34.14 
 
 
260 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  36.54 
 
 
329 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  36.54 
 
 
329 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  38.99 
 
 
357 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  35.45 
 
 
303 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  36.71 
 
 
328 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.76 
 
 
283 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  38.39 
 
 
253 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
378 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  36.32 
 
 
303 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  37.45 
 
 
267 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  34 
 
 
259 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.9 
 
 
353 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  35.17 
 
 
339 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  37.65 
 
 
269 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  37.6 
 
 
285 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.46 
 
 
272 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
271 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>