More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3746 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3746  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1187  ABC transporter related  68.67 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0268  ABC transporter related  63.3 
 
 		 277 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0835  ABC transporter related  64.29 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3784  ABC transporter related  59.68 
 
 		 265 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0935  ABC transporter related  53.78 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3866  ABC transporter related  53.26 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  39.71 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 		 329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40 
 
 		 329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  39.05 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  39.46 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  38.57 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 		 353 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40.74 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  40.83 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 		 353 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  40.47 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  35.55 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  41.41 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.85 
 
 		 413 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 329 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  39.42 
 
 		 329 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.42 
 
 		 353 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  39.35 
 
 		 387 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  38.4 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  35.55 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  36.05 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  36.05 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  39.48 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  39.91 
 
 		 350 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  36.43 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.19 
 
 		 339 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  35.22 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  35.19 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 339 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  37.39 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.56 
 
 		 352 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  31.05 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  36.76 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 		 372 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  39.71 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  36.68 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  37.55 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  36.84 
 
 		 353 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  38.1 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  35.95 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2338  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.08 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5010  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.12 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.453812  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.76 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  37.25 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  36.59 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  39.23 
 
 		 361 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  36.63 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  35.71 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.35 
 
 		 377 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  38.12 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  37.72 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  33.99 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  36.84 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5129  ABC transporter related  39.44 
 
 		 370 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  37.5 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  37.12 
 
 		 259 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.65 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  35.96 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  35.96 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  35.96 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  37.96 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  34.77 
 
 		 293 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  36.21 
 
 		 272 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  36.25 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.14 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  38.61 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>