More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3162 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3162  ABC transporter related protein  100 
 
 
265 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0334428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  69.71 
 
 
271 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0760  ABC transporter related protein  75.19 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3833  ABC transporter related protein  64.86 
 
 
262 aa  296  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3031  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP- binding protein  69.35 
 
 
274 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.62 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  53.36 
 
 
235 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.1 
 
 
234 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  50.38 
 
 
269 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  52.52 
 
 
235 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  49.06 
 
 
270 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.68 
 
 
234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  52.08 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  51.26 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
233 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  52.16 
 
 
237 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  46.47 
 
 
276 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  48.45 
 
 
279 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  48.09 
 
 
272 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  51.68 
 
 
235 aa  228  9e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
237 aa  228  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
236 aa  227  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.42 
 
 
233 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  48.37 
 
 
274 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  47.67 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  46.51 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  51.3 
 
 
235 aa  225  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.9 
 
 
236 aa  225  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 
234 aa  225  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
263 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  51.26 
 
 
236 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 
258 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  49.24 
 
 
263 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.44 
 
 
263 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  46.18 
 
 
299 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
235 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  52.28 
 
 
251 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.32 
 
 
238 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 
267 aa  222  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  48.77 
 
 
274 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  44.62 
 
 
269 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.81 
 
 
237 aa  221  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  49.16 
 
 
237 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  47.67 
 
 
278 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  46.31 
 
 
271 aa  221  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  49.16 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  49.58 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  50 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  46.95 
 
 
272 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  43.3 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  44.83 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  43.08 
 
 
269 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  50.42 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  46.18 
 
 
279 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  46.51 
 
 
279 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  46.42 
 
 
277 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  47.08 
 
 
236 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  46.01 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  48.66 
 
 
266 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  52.89 
 
 
241 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  43.85 
 
 
269 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  46.39 
 
 
276 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.89 
 
 
237 aa  218  6e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  48.77 
 
 
276 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.77 
 
 
276 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.46 
 
 
236 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.88 
 
 
236 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.76 
 
 
239 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  48.21 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  50.42 
 
 
237 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  46.12 
 
 
273 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  54.2 
 
 
246 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 
238 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  49.79 
 
 
237 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  48.36 
 
 
276 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  51.26 
 
 
242 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.8 
 
 
234 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.64 
 
 
234 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  47.18 
 
 
273 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.85 
 
 
238 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  54.73 
 
 
242 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  45.21 
 
 
270 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
237 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  46.5 
 
 
238 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  49.37 
 
 
239 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  46.9 
 
 
280 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.74 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  46.31 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.28 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 
260 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  46.31 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.25 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  47.76 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  47.91 
 
 
265 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  42.69 
 
 
281 aa  214  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  49.16 
 
 
265 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  47.13 
 
 
266 aa  214  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>