More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3031 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3031  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP- binding protein  100 
 
 		 274 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  73.13 
 
 		 271 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0760  ABC transporter related protein  73.72 
 
 		 274 aa  351  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3162  ABC transporter related protein  69.35 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0334428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3833  ABC transporter related protein  62.98 
 
 		 262 aa  291  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  54.85 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.59 
 
 		 234 aa  248  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  54.01 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  56.12 
 
 		 235 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.63 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  52.32 
 
 		 233 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  48.55 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  48.95 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  53.59 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  55.65 
 
 		 251 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 233 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  53.31 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  52.32 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  50.41 
 
 		 235 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  51.9 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  51.67 
 
 		 237 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  48.95 
 
 		 237 aa  232  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  51.67 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  52.07 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.21 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  51 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.72 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  51.05 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  51.14 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  48.58 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  52.46 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  47.26 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  55.41 
 
 		 235 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1069  ABC transporter related  51.03 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  49.61 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  51.46 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  47.68 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  50.2 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  53.16 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  55.04 
 
 		 238 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.84 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  49.37 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  51.87 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  51.88 
 
 		 258 aa  225  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  50.38 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  47.9 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  47.68 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  50.41 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  52.1 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.61 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2041  ABC transporter related  49.15 
 
 		 388 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247921 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  50.83 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.97 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  48.75 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  47.11 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.84 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  48.61 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  54.43 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  48.39 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  49.17 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  55.24 
 
 		 242 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.68 
 
 		 236 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.16 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  52.32 
 
 		 238 aa  221  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.54 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  50.41 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  49.79 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  53.11 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  52.52 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  53.11 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.88 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  48.21 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.92 
 
 		 238 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  48.33 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  52.7 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  50 
 
 		 237 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  44.17 
 
 		 236 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 237 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  49.79 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  54.2 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  47.68 
 
 		 234 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  48.52 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  46.31 
 
 		 437 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.05 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  48.95 
 
 		 242 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  49.79 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>