112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0422 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  844    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  77.59 
 
 		 427 aa  655    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  68.33 
 
 		 451 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  56.9 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  56.66 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  57.46 
 
 		 406 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  46.88 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  47.13 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  46.63 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  46.63 
 
 		 462 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  45.14 
 
 		 413 aa  319  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  42.24 
 
 		 416 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  39.47 
 
 		 413 aa  308  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  40.62 
 
 		 423 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  40.62 
 
 		 423 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  40.34 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.76 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  39.73 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  32.6 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  23.97 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  31.6 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  28.21 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  27.16 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  26.89 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.48 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  27.85 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  27.67 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  26.84 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  26.41 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  25.23 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  25.52 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  27.96 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  21.03 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  25.36 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  26.84 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  26.53 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  24.2 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  26.4 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  24.43 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  25.89 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  24.68 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  25.11 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  25.61 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  23.97 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  31.19 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  26.69 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  24.9 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  26.59 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6071  lipid-A-disaccharide synthase  25.96 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2006  lipid-A-disaccharide synthase  25.96 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  25.11 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  24.52 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  23.28 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  22.99 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  37.18 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  25.76 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  24.29 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  26.9 
 
 		 375 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  24.05 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  25.76 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  23.48 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2026  lipid-A-disaccharide synthase  25.73 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  25.7 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  26.9 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1270  lipid-A-disaccharide synthase  25.73 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  24.4 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  22.41 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  27.83 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  23.41 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2039  lipid-A-disaccharide synthase  25.73 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665619  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  24.4 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  24.07 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  27.75 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1908  lipid-A-disaccharide synthase  25.73 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.480286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  25.42 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  25.09 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  24.66 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  23.04 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  25.49 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  23.48 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  27.75 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  23.98 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  24.84 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  21.46 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  24.84 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5316  lipid-A-disaccharide synthase  25.24 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0743741  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  25.11 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  24.05 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  24.07 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  24.84 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  24.84 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  24.07 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  24.07 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  24.76 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  21.85 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  24.49 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>