50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1378 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  827    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  56.2 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  52.9 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  51.72 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  51.72 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  50.61 
 
 		 413 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  50.11 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  47.15 
 
 		 482 aa  418  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  45.19 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  45.39 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  39.33 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  43.33 
 
 		 451 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  38.85 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  38.63 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  38.78 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  38.78 
 
 		 428 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  40.21 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  37.41 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  31.85 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  29.68 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  22.72 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  27.3 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  26.88 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  24.59 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  28.63 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  28.63 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  25.98 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  26.67 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  27.05 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  28.79 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  23.7 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  25.69 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  22.08 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  25.85 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  27.14 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  24.18 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  23.14 
 
 		 372 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  24.12 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  23.08 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  23.44 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  24 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  24.15 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  21.51 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28.8 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  23.08 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  25.66 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  32.31 
 
 		 380 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  24.61 
 
 		 384 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  24.55 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>