73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_01231 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  98.59 
 
 
425 aa  855    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  58.13 
 
 
451 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  61.25 
 
 
406 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  55.9 
 
 
427 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  56.66 
 
 
423 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  48.33 
 
 
428 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  48.81 
 
 
425 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  48.56 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  47.38 
 
 
462 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  39.11 
 
 
413 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  38.68 
 
 
419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 
482 aa  286  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  37.41 
 
 
423 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.16 
 
 
423 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  39.28 
 
 
413 aa  276  7e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.83 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  35.6 
 
 
450 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  27.15 
 
 
366 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  24.64 
 
 
389 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  26.33 
 
 
389 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  23.94 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  25.61 
 
 
388 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  23 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.18 
 
 
379 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  23.71 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  23.69 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  23.28 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  23.97 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  23.69 
 
 
383 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  23.29 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  26.32 
 
 
384 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  25.37 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  25.75 
 
 
384 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  22.79 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  24.9 
 
 
385 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  22.73 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  20 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  21.05 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  22.75 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  24.7 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  20.24 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  21.86 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  23.33 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  23.33 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  21.77 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  24.37 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  22.04 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  21.76 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  26.19 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  21.05 
 
 
380 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  23.96 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  22.46 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  22.57 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  23.45 
 
 
388 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2040  lipid-A-disaccharide synthase  23.43 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000710556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  24.41 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  22.31 
 
 
385 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  23.44 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  24.12 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  24.63 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  19.18 
 
 
376 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  24.86 
 
 
367 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2001  lipid-A-disaccharide synthase  20.63 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  23.08 
 
 
383 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  23.31 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>