57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_00671 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  834    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  61.4 
 
 
451 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  61.25 
 
 
425 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  61.5 
 
 
425 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  58.46 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  57.46 
 
 
423 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  53.7 
 
 
425 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  52.37 
 
 
462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  50.38 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  50.4 
 
 
428 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  41.19 
 
 
413 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  38.19 
 
 
419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  38.68 
 
 
423 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  38.68 
 
 
423 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  38.8 
 
 
416 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 
482 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  37.15 
 
 
413 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 
450 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  28.18 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  25.52 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  25.23 
 
 
389 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  25.1 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  25.1 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  22.63 
 
 
384 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  25.1 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  25.82 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  24 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  26.01 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  20.73 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  24.18 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  28.18 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  26.85 
 
 
375 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  25.56 
 
 
375 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  25.65 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  21.67 
 
 
379 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  22.67 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  23.18 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  23.77 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  20.33 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  24.7 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  24.19 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  23.7 
 
 
388 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  26.04 
 
 
378 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  26.04 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  23.46 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  23.46 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  20.94 
 
 
383 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  20.89 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3676  hypothetical protein  24.11 
 
 
707 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  24.74 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  21.48 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  23.28 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  22.18 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  25.67 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  23.14 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  23.21 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4935  lipid-A-disaccharide synthase  23.29 
 
 
396 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0247696  normal  0.131407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>