39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00681 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  100 
 
 
425 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  72.92 
 
 
421 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  73.35 
 
 
428 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  72.64 
 
 
462 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  46.88 
 
 
423 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  47.07 
 
 
451 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  46.19 
 
 
427 aa  421  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  48.81 
 
 
425 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  53.7 
 
 
406 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  48.81 
 
 
425 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  38.5 
 
 
423 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.27 
 
 
482 aa  302  9e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  38.26 
 
 
423 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  37.02 
 
 
413 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  36.21 
 
 
419 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.98 
 
 
416 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  36.91 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  34 
 
 
450 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  24.48 
 
 
366 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  22.91 
 
 
389 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  21.14 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  25.11 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  26.95 
 
 
388 aa  60.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  20.29 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.42 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  18.66 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  21.14 
 
 
383 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  21.14 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  20.91 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  21.14 
 
 
383 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  24.67 
 
 
402 aa  47  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  19.67 
 
 
384 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  21.56 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  21.58 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1432  lipid-A-disaccharide synthase  25.37 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.334772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  21.48 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  23.29 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  24.1 
 
 
363 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  19.67 
 
 
384 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>