44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0061 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  88.12 
 
 		 462 aa  740    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  72.92 
 
 		 425 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  87.89 
 
 		 428 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  48.81 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  46.89 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  48.1 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  45.39 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  51.32 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  45.1 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  39.18 
 
 		 423 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  39.18 
 
 		 423 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  38.15 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  35.65 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.41 
 
 		 416 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  36.69 
 
 		 413 aa  288  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  32.67 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  24.88 
 
 		 366 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  23.29 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  22.8 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.58 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  21.55 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  25.62 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  24.35 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  21.4 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  21.37 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  22.04 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  21.14 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  26.25 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  23.08 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  20.87 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  21.36 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  21.14 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  20.09 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  20.2 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  19.6 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  24.26 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  32.05 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  20.16 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  29.25 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  22.51 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  20.08 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  21.91 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>