50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00701 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  100 
 
 
428 aa  860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  92.29 
 
 
462 aa  778    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  87.89 
 
 
421 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  73.35 
 
 
425 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  49.29 
 
 
425 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  48.33 
 
 
425 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  46.63 
 
 
423 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  44.79 
 
 
451 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  44.09 
 
 
427 aa  409  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  50.4 
 
 
406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  40.53 
 
 
423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  40.29 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  38.85 
 
 
416 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 
482 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  36.93 
 
 
419 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  37.44 
 
 
413 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  38.06 
 
 
413 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 
450 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  26.12 
 
 
366 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  22.57 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  22.12 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.17 
 
 
379 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  24.77 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  21.79 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  22.69 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  21.37 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  21.37 
 
 
384 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  23.77 
 
 
388 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  20.75 
 
 
384 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  20.9 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  23.76 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  20.9 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  20.8 
 
 
384 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  25.2 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  20.9 
 
 
383 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  25.42 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  20.97 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  19.34 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 
385 aa  46.6  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  20.19 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  19.51 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  19.51 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  19.67 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  19.27 
 
 
384 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  26.74 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  20.88 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  24.61 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  24.48 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  19.13 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>