53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2769 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
416 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  64.42 
 
 
423 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  64.42 
 
 
423 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  61.69 
 
 
419 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  55.97 
 
 
482 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  59.38 
 
 
413 aa  501  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  51.58 
 
 
450 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  52.9 
 
 
413 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  41.01 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  42.24 
 
 
423 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  40.19 
 
 
451 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  37.02 
 
 
421 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  37.98 
 
 
425 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  38.85 
 
 
428 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  38.37 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  38.8 
 
 
406 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  37.02 
 
 
425 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  36.83 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  31.11 
 
 
389 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  28.88 
 
 
389 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  26 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  26.34 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  22.08 
 
 
379 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  25.45 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  25.24 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  22.22 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  22.41 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  22.78 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17611  lipid-A-disaccharide synthase  26.69 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798292  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  24.27 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0905  lipid-A-disaccharide synthase  26.69 
 
 
390 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.288489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  23.75 
 
 
383 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  23.12 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  23.33 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  24.1 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  23.98 
 
 
382 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  20.98 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  24.8 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.58 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  25.31 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  22.91 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  24.68 
 
 
384 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  26.29 
 
 
384 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  22.56 
 
 
376 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  21.58 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  24.41 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  22.26 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  21.82 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  25.19 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  24.83 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  21.31 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>