32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2763 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  100 
 
 
389 aa  750    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  61.82 
 
 
389 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  31.6 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  28.47 
 
 
413 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  28.33 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  25.86 
 
 
366 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  29.21 
 
 
450 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  23.15 
 
 
425 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  29.01 
 
 
423 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  29.01 
 
 
423 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  30.25 
 
 
413 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  31.6 
 
 
423 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  27.02 
 
 
482 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  31.04 
 
 
451 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  32.69 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  26.81 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  26.33 
 
 
425 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  22.82 
 
 
428 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  22.57 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  22.82 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  25.98 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  31.03 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  30.8 
 
 
376 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  29.7 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  33.08 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  26.24 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  27.78 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  29.56 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  28.19 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  24.7 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  28.7 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>