40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3384 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  99.76 
 
 
423 aa  863    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
423 aa  864    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  64.42 
 
 
416 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  61.15 
 
 
419 aa  525  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  53.94 
 
 
482 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  55.82 
 
 
413 aa  482  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  53.14 
 
 
450 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  51.62 
 
 
413 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  40.53 
 
 
428 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  42.58 
 
 
451 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  39.18 
 
 
421 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  38.94 
 
 
462 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  38.26 
 
 
425 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  40.62 
 
 
423 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  40.29 
 
 
427 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  37.65 
 
 
425 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  38.68 
 
 
406 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  37.16 
 
 
425 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  29.74 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  24.24 
 
 
366 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  29.02 
 
 
389 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  25.66 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  23.6 
 
 
379 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  23.34 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  24.21 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  22.38 
 
 
384 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  21.55 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  25.84 
 
 
383 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  25.47 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  25.47 
 
 
383 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  23.79 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  20.6 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  23.96 
 
 
382 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  24.07 
 
 
377 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  21.99 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  25.2 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  22.61 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  25.49 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  24.59 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  22.78 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>