73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1422 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_01231  hypothetical protein  98.59 
 
 		 425 aa  855    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.208139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1422  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  862    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03231  lipid A disaccharide synthetase-like protein  58.13 
 
 		 451 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00671  hypothetical protein  61.5 
 
 		 406 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.997015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2258  hypothetical protein  56.14 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.872637  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0422  hypothetical protein  56.9 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00701  lipid A disaccharide synthetase-like protein  49.29 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00681  lipid A disaccharide synthetase-like protein  48.81 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.888234  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  48.33 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0061  hypothetical protein  48.81 
 
 		 421 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1378  hypothetical protein  39.6 
 
 		 413 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1699  hypothetical protein  38.92 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000568429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3228  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.71 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.903486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2729  hypothetical protein  37.9 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3384  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.65 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0540  hypothetical protein  40 
 
 		 413 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2769  putative lipid-A-disaccharide synthase  37.02 
 
 		 416 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0261  putative lipid-A-disaccharide synthase  36.03 
 
 		 450 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.504944  normal  0.0423311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0824  hypothetical protein  27.16 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0867  glycosyl transferase family 19  25.12 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.822802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2763  Lipid A disaccharide synthetase  26.81 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.973699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  23.94 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  25.2 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0132  hypothetical protein  23.24 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.195469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  22.75 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  24.14 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  24.28 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  22.84 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  23.29 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  23.29 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  25.37 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  22.89 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  25.75 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  26.32 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  21.03 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  25 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  22.67 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  19.6 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2612  lipid-A-disaccharide synthase  22.33 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0932  lipid-A-disaccharide synthase  22.73 
 
 		 399 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.600783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  21.05 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  21.76 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1664  lipid-A-disaccharide synthase  23.33 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1682  lipid-A-disaccharide synthase  23.33 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  21.55 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  22.27 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  23.27 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  21.63 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  21.05 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  22.96 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3322  lipid-A-disaccharide synthase  25.5 
 
 		 413 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  22.88 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  23.96 
 
 		 375 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1836  lipid-A-disaccharide synthase  23.74 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.887238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2569  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  19.59 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  22.81 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  23.01 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1325  lipid-A-disaccharide synthase  22.12 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1236  lipid-A-disaccharide synthase  24.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  23.44 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  23.44 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2837  lipid-A-disaccharide synthase  23.94 
 
 		 381 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  23.36 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  23.92 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  24.86 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2572  lipid-A-disaccharide synthase  25.48 
 
 		 385 aa  43.1  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126435  normal  0.026533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>