68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0112 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 677 aa  1245    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0954339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.06 
 
 		 1400 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.07 
 
 		 4334 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 		 965 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  28.94 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.2 
 
 		 1156 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.27 
 
 		 2954 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.51 
 
 		 860 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.14 
 
 		 595 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  25.51 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  26.65 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  27.25 
 
 		 1363 aa  63.9  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  27.29 
 
 		 1572 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.82 
 
 		 946 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  26.65 
 
 		 1079 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  27.75 
 
 		 613 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.01 
 
 		 1499 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  28.39 
 
 		 1217 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  27.4 
 
 		 3954 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.8 
 
 		 2245 aa  56.6  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  25.6 
 
 		 795 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  26.88 
 
 		 1072 aa  56.6  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  27.53 
 
 		 959 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  28.06 
 
 		 1855 aa  52.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  24.13 
 
 		 1534 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  25 
 
 		 1787 aa  53.1  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  27.07 
 
 		 1279 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1880 aa  52  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  26.89 
 
 		 6581 aa  51.6  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 		 491 aa  50.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3277  hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 		 371 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.477972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  32.17 
 
 		 928 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  27.33 
 
 		 4800 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 		 1287 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 		 982 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.95 
 
 		 2911 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  29.32 
 
 		 357 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  27.32 
 
 		 437 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.75 
 
 		 3598 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  28.42 
 
 		 387 aa  47.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 		 245 aa  47.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  27.14 
 
 		 639 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  26.23 
 
 		 1532 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  30.26 
 
 		 606 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  28.61 
 
 		 396 aa  47  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3067  hypothetical protein  26.78 
 
 		 405 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.871952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  30.75 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  24.63 
 
 		 1764 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  30.99 
 
 		 5171 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  26.27 
 
 		 682 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.3 
 
 		 2689 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  28.44 
 
 		 833 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  27.78 
 
 		 3619 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  26.56 
 
 		 437 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  25.39 
 
 		 14829 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1424 aa  45.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.46 
 
 		 2667 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  30.35 
 
 		 232 aa  45.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.58 
 
 		 950 aa  44.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  27.75 
 
 		 1164 aa  44.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.88 
 
 		 1586 aa  44.7  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50.94 
 
 		 5218 aa  44.3  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  27.27 
 
 		 257 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.01 
 
 		 4798 aa  44.3  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 		 313 aa  43.9  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  26.16 
 
 		 724 aa  43.9  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>