144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0400 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  885    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  68.28 
 
 		 455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  59.56 
 
 		 463 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  54.59 
 
 		 455 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  52.09 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  52.06 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 454 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 454 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 		 457 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  35.9 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  29.69 
 
 		 501 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  30.73 
 
 		 500 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  32.61 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  29.2 
 
 		 500 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  29.38 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  27.89 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  35.59 
 
 		 571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1775  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  23.65 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 920 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  22.64 
 
 		 1296 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.12 
 
 		 487 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 		 604 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 907 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 945 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 553 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  27.56 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 575 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 899 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 899 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  27.56 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 905 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  21.74 
 
 		 589 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  29.2 
 
 		 730 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  26.92 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.805184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 781 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1977 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.5 
 
 		 790 aa  47.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.83 
 
 		 351 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  24.52 
 
 		 534 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  25.47 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  23.74 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  25.47 
 
 		 498 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  26.57 
 
 		 913 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0402  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 618 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.928095  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  25.45 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.38 
 
 		 653 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.2 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  21.98 
 
 		 614 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 591 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.09 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  25.71 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  26.92 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  28.41 
 
 		 527 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  25.68 
 
 		 784 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  26.04 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 768 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  23.53 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 807 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 768 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 610 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.8 
 
 		 1643 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  25.71 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  25.48 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 662 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 885 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 3470 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  23.81 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 662 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3803  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 846 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109811  normal  0.511029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  25.24 
 
 		 903 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1162 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  24.68 
 
 		 1384 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 2783 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 540 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 712 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1833  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 680 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  24.52 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>