141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_17861 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  91.41 
 
 
454 aa  819    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
454 aa  917    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  72.25 
 
 
457 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  92.95 
 
 
454 aa  832    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  46.07 
 
 
455 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
463 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  40.31 
 
 
455 aa  349  4e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  40.27 
 
 
449 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  28.88 
 
 
457 aa  189  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  27.69 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  27.23 
 
 
500 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  27.94 
 
 
496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  29.01 
 
 
487 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  36.51 
 
 
500 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  29.6 
 
 
501 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  38.31 
 
 
571 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  23.58 
 
 
587 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 
599 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
608 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  30.97 
 
 
364 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  30.97 
 
 
364 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
801 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.06 
 
 
653 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 
899 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  26.87 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  26.85 
 
 
370 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  19.63 
 
 
458 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
673 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  27.32 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.83 
 
 
575 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  28.29 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  26.67 
 
 
555 aa  50.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
895 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.95 
 
 
604 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
504 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  24.74 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.4 
 
 
2161 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 
752 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 
2153 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  25.68 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  25.68 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  25.68 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  25.68 
 
 
337 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.49 
 
 
489 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
461 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.88 
 
 
383 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  25.49 
 
 
383 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 
590 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
487 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 
608 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  25.49 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
498 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
590 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.78 
 
 
901 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.12 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
493 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  24.84 
 
 
504 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
594 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
799 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1444  nitrogen regulation protein ntrB  25.48 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
501 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.98 
 
 
595 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
664 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  28.03 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  25.83 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
504 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  22.16 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  25.5 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 
340 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4989  histidine kinase  23.18 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784849  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.43 
 
 
837 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  25 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.28 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  23.84 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  24.36 
 
 
581 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
519 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  27.39 
 
 
498 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
680 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  25.83 
 
 
571 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  23.11 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  23.81 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  21.79 
 
 
1118 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 
899 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.96 
 
 
893 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  23.08 
 
 
935 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>