More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0260 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  100 
 
 		 487 aa  974    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  42.89 
 
 		 500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  41.75 
 
 		 496 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  41.94 
 
 		 501 aa  316  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  39.76 
 
 		 500 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  39.76 
 
 		 500 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  39.03 
 
 		 571 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  39.96 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  32.61 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  32.24 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  32.13 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 454 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 454 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 905 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  24.89 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  24.27 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 885 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  25.62 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 907 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.15 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 901 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  25.52 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  26.4 
 
 		 1125 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 1125 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 984 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 902 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  24.58 
 
 		 530 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 		 917 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 907 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  26.92 
 
 		 905 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  24.71 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 		 1271 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 901 aa  65.1  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.29 
 
 		 818 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 2161 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.65 
 
 		 1172 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2153  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 		 635 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.519721  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  24.79 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 763 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 1917 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  25.31 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  23.31 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3228  Osmosensitive K channel His kinase sensor  26.64 
 
 		 854 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 		 763 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  26.34 
 
 		 917 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 		 917 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 738 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  27.31 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2443  histidine kinase  24.6 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 678 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 887 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06870  hybrid histidine protein kinase RetS  26.97 
 
 		 933 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 887 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.34 
 
 		 917 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.28 
 
 		 1334 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 846 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.73 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  24.34 
 
 		 925 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  25 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  26.29 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  24.69 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3552  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 1009 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.88 
 
 		 929 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  24.7 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3217  Cache sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  22.96 
 
 		 810 aa  60.1  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 699 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  24.2 
 
 		 905 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  22.93 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4132  histidine kinase  22.89 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  26.39 
 
 		 903 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 662 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.32 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  22.22 
 
 		 801 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 		 1479 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.74 
 
 		 592 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  24.36 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.65 
 
 		 1352 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  25.43 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>