150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1151 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  916    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  99.35 
 
 		 461 aa  910    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  63.74 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  58.79 
 
 		 463 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  52.09 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  49.34 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 		 454 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  45.59 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  31.58 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  30.51 
 
 		 501 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  31.86 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  31.86 
 
 		 500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  39.67 
 
 		 500 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  30.7 
 
 		 487 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  29.28 
 
 		 496 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  29.87 
 
 		 571 aa  123  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 905 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 905 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 551 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 575 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  24.49 
 
 		 905 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.82 
 
 		 730 aa  53.9  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  21.4 
 
 		 249 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 		 1068 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 907 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  29.75 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 		 591 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 899 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 899 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  23.87 
 
 		 587 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.11 
 
 		 778 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.64 
 
 		 934 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.3 
 
 		 673 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.34 
 
 		 778 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 		 1322 aa  50.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 895 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  21.03 
 
 		 248 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  24.89 
 
 		 1364 aa  50.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.8 
 
 		 777 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 528 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.828791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1578 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1611 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.65 
 
 		 778 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.65 
 
 		 778 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.65 
 
 		 778 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 771 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1507  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.35 
 
 		 819 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 872 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 		 908 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 		 801 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.35 
 
 		 778 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 718 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  26.36 
 
 		 493 aa  47.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.64 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.94 
 
 		 778 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  22.39 
 
 		 906 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 3470 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1149  histidine kinase  27.15 
 
 		 471 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 604 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.66 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.64 
 
 		 656 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755968  normal  0.278919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 965 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 546 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.11 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  29.1 
 
 		 1334 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 907 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 594 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 		 940 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0950  histidine kinase  27.85 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2117  histidine kinase  23.58 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201889  normal  0.773102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1792 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  23.83 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1195  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 609 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.17 
 
 		 611 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.91 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>