157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_17701 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1671  signal transduction histidine kinase  92.73 
 
 
454 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.690264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17861  Signal transduction histidine kinase  92.95 
 
 
454 aa  834    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.942375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17661  Signal transduction histidine kinase  72.03 
 
 
457 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17701  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
454 aa  914    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.312646  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1151  signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
461 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20251  Signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
461 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.617847  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16991  hypothetical protein  46.29 
 
 
455 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.38844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22701  Signal transduction histidine kinase  44.28 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1929  hypothetical protein  41.5 
 
 
455 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.541714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0400  hypothetical protein  41.72 
 
 
449 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.264302  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1517  histidine kinase  29.85 
 
 
457 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.569044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0260  histidine kinase  29.6 
 
 
487 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.205252  normal  0.0486545 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3736  histidine kinase  27.47 
 
 
500 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3788  histidine kinase  27.02 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0752677  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5096  histidine kinase  27.48 
 
 
496 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4098  histidine kinase  35.96 
 
 
501 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0501  histidine kinase  36.11 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0972  histidine kinase  37.25 
 
 
571 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0508248  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  24.56 
 
 
587 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
599 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
608 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 
899 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 
673 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.69 
 
 
458 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  27.52 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
434 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.68 
 
 
364 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.68 
 
 
364 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1525  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.45 
 
 
653 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
504 aa  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  25.29 
 
 
555 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 
581 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 
575 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
418 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1465  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
895 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.113581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 
2153 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.47 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 
799 aa  49.3  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.04 
 
 
489 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 
885 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5680  histidine kinase  23.21 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.534084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  27.04 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25 
 
 
650 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
664 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 
801 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 
2161 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  26.97 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20.85 
 
 
571 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
905 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.43 
 
 
604 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  21.56 
 
 
595 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
478 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  24.71 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  23.77 
 
 
468 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  25.49 
 
 
383 aa  47.4  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3744  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 
472 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4624  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 
472 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.587522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 
369 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
392 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  22.63 
 
 
604 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  24.44 
 
 
457 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2066  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 
496 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000687281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  24.36 
 
 
581 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
706 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  25.49 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  24.52 
 
 
506 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.51 
 
 
934 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
498 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
752 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.99 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.51 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  24.71 
 
 
907 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
907 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  25.16 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  21.02 
 
 
739 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  24.48 
 
 
2303 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  22.16 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11831  adaptive-response sensory kinase  25.5 
 
 
372 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.5 
 
 
509 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 
907 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 
899 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  25.16 
 
 
340 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
501 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  22.58 
 
 
376 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  23.81 
 
 
464 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.91 
 
 
790 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  24.07 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11841  adaptive-response sensory kinase  27.01 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.250439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4989  histidine kinase  21.85 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784849  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
905 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  24.18 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>