More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2939 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  100 
 
 
739 aa  1509    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  53.28 
 
 
694 aa  726    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
679 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  40.43 
 
 
743 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  44.32 
 
 
743 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  41.31 
 
 
583 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  41.64 
 
 
583 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
844 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  36.67 
 
 
502 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  34.21 
 
 
501 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  35.33 
 
 
481 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
501 aa  168  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  34.54 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  34.87 
 
 
501 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
480 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
501 aa  164  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  34.54 
 
 
501 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  35.27 
 
 
469 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  34.54 
 
 
501 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  36.39 
 
 
358 aa  163  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
501 aa  162  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  33.78 
 
 
502 aa  161  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
459 aa  160  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  38.58 
 
 
360 aa  158  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
468 aa  157  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
385 aa  154  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  35.79 
 
 
385 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  36.49 
 
 
385 aa  153  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  36.49 
 
 
385 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  35.79 
 
 
385 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  35.79 
 
 
385 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
385 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
385 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  36.14 
 
 
385 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
407 aa  152  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  35.44 
 
 
385 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
384 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  35.71 
 
 
486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  31.21 
 
 
362 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  29.93 
 
 
355 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
375 aa  143  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  29.61 
 
 
337 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  32.43 
 
 
368 aa  141  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
331 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  29.61 
 
 
375 aa  138  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
368 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
368 aa  137  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
368 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  31.54 
 
 
368 aa  137  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  30.94 
 
 
291 aa  135  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
381 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  30.94 
 
 
288 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  29.81 
 
 
291 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
365 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  31.12 
 
 
368 aa  127  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  31.33 
 
 
447 aa  127  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  30.8 
 
 
368 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
484 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.21 
 
 
484 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  27.02 
 
 
615 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
361 aa  117  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.1 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
340 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.84 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  27.47 
 
 
484 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
484 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
484 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
484 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  27.44 
 
 
494 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1402  sensor histidine kinase  27.83 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00361795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  28.9 
 
 
340 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
462 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  29.01 
 
 
337 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  28.9 
 
 
314 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  26.41 
 
 
463 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.6 
 
 
461 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.27 
 
 
467 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
463 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  28.8 
 
 
337 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.96 
 
 
508 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  25.25 
 
 
615 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
463 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.76 
 
 
463 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  32.54 
 
 
226 aa  108  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.76 
 
 
463 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
513 aa  108  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  29.5 
 
 
337 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
536 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
504 aa  107  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.42 
 
 
463 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
413 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
470 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0361  histidine kinase  27.36 
 
 
297 aa  106  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>