More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0361 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0361  histidine kinase  100 
 
 
297 aa  609  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1195  sensor histidine kinase  37.98 
 
 
301 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000111756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1023  sensor histidine kinase  37.69 
 
 
301 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0168106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2321  histidine kinase  29.43 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  31.93 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
331 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0685  histidine kinase  28.97 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3232  histidine kinase  30.8 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  27.74 
 
 
385 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  30.74 
 
 
385 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  30.94 
 
 
502 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  30.58 
 
 
481 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2292  histidine kinase  28.68 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.924243  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3946  histidine kinase  29.93 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
385 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
385 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  28.87 
 
 
385 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  31.94 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  30.39 
 
 
385 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  29.58 
 
 
385 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
582 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0591  sensor histidine kinase  29.45 
 
 
311 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  29.72 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  29.72 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4661  sensor histidine kinase  29.5 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4282  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
311 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
407 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4662  sensor histidine kinase  29.56 
 
 
311 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
338 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
585 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  28.98 
 
 
743 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4646  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
331 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4271  sensor histidine kinase  29.14 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.565244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  30.66 
 
 
501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4432  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
311 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4649  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
311 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  30.04 
 
 
337 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4776  sensor histidine kinase  28.78 
 
 
311 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
459 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  32.43 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4364  histidine kinase  28.73 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  28.03 
 
 
743 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
484 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
484 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  32.81 
 
 
583 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
484 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  29.57 
 
 
583 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
484 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  29.87 
 
 
694 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
501 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
484 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  32.68 
 
 
502 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
479 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
501 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  29.41 
 
 
501 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
501 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
487 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
480 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  29.8 
 
 
501 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  28.97 
 
 
469 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
609 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  27.36 
 
 
739 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  30.31 
 
 
501 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.81 
 
 
455 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.81 
 
 
455 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  29.11 
 
 
377 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
382 aa  105  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  32.91 
 
 
479 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
590 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  23.33 
 
 
508 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
368 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
468 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
608 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  27.39 
 
 
469 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  30.88 
 
 
501 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
381 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  29.87 
 
 
368 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
844 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  29.54 
 
 
362 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  30.73 
 
 
386 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  28.17 
 
 
389 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
413 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  29.55 
 
 
368 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  31.03 
 
 
385 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
395 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  27.15 
 
 
368 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  29.88 
 
 
370 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>