More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0460 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  100 
 
 		 743 aa  1487    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  94.34 
 
 		 743 aa  1352    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 844 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  44.32 
 
 		 739 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  44.57 
 
 		 694 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 679 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  40.47 
 
 		 583 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  40.47 
 
 		 583 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  33.33 
 
 		 502 aa  171  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  33.66 
 
 		 481 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  35.59 
 
 		 501 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  35.41 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 385 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 385 aa  162  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  34.46 
 
 		 501 aa  162  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  33.87 
 
 		 385 aa  161  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  35.13 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 480 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  35.13 
 
 		 501 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 384 aa  157  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 459 aa  157  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  36.05 
 
 		 469 aa  157  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 501 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  37.88 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  35.98 
 
 		 358 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  31.92 
 
 		 502 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  33.84 
 
 		 355 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 375 aa  142  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  36.16 
 
 		 362 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 375 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  33.33 
 
 		 337 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 331 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 361 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 407 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  33.96 
 
 		 288 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 381 aa  128  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  34.47 
 
 		 291 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  33.58 
 
 		 291 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 368 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 368 aa  124  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 368 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 484 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 368 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  31.61 
 
 		 368 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 368 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  32.12 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  32.12 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  32.72 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 484 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  29.17 
 
 		 447 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 470 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 455 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 455 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  30.97 
 
 		 368 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 815 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  29.69 
 
 		 337 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 382 aa  115  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  34.45 
 
 		 226 aa  114  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  30.18 
 
 		 486 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 368 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 453 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 368 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 364 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  26.38 
 
 		 370 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 340 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 487 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  28.76 
 
 		 386 aa  111  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0361  histidine kinase  28.03 
 
 		 297 aa  111  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 672 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 666 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 666 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.08 
 
 		 364 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 453 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 453 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 459 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.08 
 
 		 364 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 504 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 453 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.96 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 381 aa  110  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 340 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  26.96 
 
 		 453 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>