More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2814 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 679 aa  1389    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  49.51 
 
 		 694 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  50 
 
 		 739 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  44.51 
 
 		 743 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  41.77 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 844 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 583 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  33.22 
 
 		 502 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  33.55 
 
 		 502 aa  157  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  34.55 
 
 		 501 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 358 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  33.22 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  35.43 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  35.1 
 
 		 501 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  37.99 
 
 		 360 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 480 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 501 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 501 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  34.77 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  34.44 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 385 aa  138  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  28.83 
 
 		 362 aa  138  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  29.77 
 
 		 385 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  30 
 
 		 375 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  29.24 
 
 		 385 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 459 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 384 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 375 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  29.31 
 
 		 355 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  27.63 
 
 		 337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 368 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 368 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 368 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  31.09 
 
 		 368 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  29.6 
 
 		 288 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  31.34 
 
 		 447 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  31.07 
 
 		 486 aa  124  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  27.52 
 
 		 291 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  29.84 
 
 		 377 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  27.84 
 
 		 291 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 365 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  32.07 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 484 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  26.57 
 
 		 484 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 356 aa  114  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 368 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 463 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  30.07 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30.47 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 455 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 455 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 484 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 332 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1834  histidine kinase  29.62 
 
 		 348 aa  110  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 484 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  26.3 
 
 		 484 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  32.37 
 
 		 226 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  30.13 
 
 		 386 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  26.77 
 
 		 340 aa  108  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 585 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  29.88 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 646 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  24.4 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  27.33 
 
 		 346 aa  105  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 382 aa  105  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 643 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 445 aa  104  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 584 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  25.85 
 
 		 340 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 576 aa  103  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 608 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 1010 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 582 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>