More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0868 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 844 aa  1697    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  40.32 
 
 		 743 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  40.53 
 
 		 743 aa  426  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 679 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  40.73 
 
 		 583 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  40.4 
 
 		 583 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  35.34 
 
 		 739 aa  224  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  39.8 
 
 		 694 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  34.58 
 
 		 481 aa  171  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  36.58 
 
 		 502 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  36.16 
 
 		 385 aa  168  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 385 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  35.74 
 
 		 385 aa  165  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 385 aa  164  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  35.08 
 
 		 385 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  36.54 
 
 		 501 aa  161  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  37.21 
 
 		 501 aa  157  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 384 aa  157  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  36.88 
 
 		 501 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 469 aa  155  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 358 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 501 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 501 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 501 aa  154  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 468 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  36.54 
 
 		 480 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  38.06 
 
 		 501 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  35 
 
 		 502 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  37.77 
 
 		 360 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 407 aa  147  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  32.67 
 
 		 362 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  29.94 
 
 		 375 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 470 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  29.62 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 381 aa  128  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  29.62 
 
 		 355 aa  128  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  28.66 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 331 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  31.54 
 
 		 288 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 361 aa  122  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 455 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 455 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  31.54 
 
 		 291 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 368 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 368 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 368 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 368 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 484 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  30.07 
 
 		 447 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  29.44 
 
 		 370 aa  120  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 585 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  31.87 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 815 aa  119  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 368 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 484 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 484 aa  118  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  25.56 
 
 		 356 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  33.46 
 
 		 484 aa  117  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  29.62 
 
 		 291 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  29.18 
 
 		 386 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 368 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 484 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 484 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  28.72 
 
 		 310 aa  115  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 457 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  31.25 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  28.76 
 
 		 368 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 349 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2180  histidine kinase  24.66 
 
 		 530 aa  112  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  33.79 
 
 		 337 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  24.79 
 
 		 377 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 652 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 604 aa  110  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 593 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 504 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 453 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 453 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 453 aa  110  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  26.42 
 
 		 352 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 453 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 459 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  31.43 
 
 		 486 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  31.36 
 
 		 787 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.07 
 
 		 467 aa  109  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 354 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  32.27 
 
 		 787 aa  109  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 489 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1123  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 482 aa  108  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.702413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 337 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>