More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1734 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
381 aa  776    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.21 
 
 
381 aa  368  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  47.44 
 
 
361 aa  268  8e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
382 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  39.32 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  40.34 
 
 
385 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
384 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  39.66 
 
 
385 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  41.2 
 
 
385 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
407 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  36.42 
 
 
502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  36.42 
 
 
481 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
468 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  35.99 
 
 
502 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  35.06 
 
 
501 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
501 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
501 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
459 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  34.99 
 
 
362 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
501 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
501 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
501 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  35.06 
 
 
469 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  32.4 
 
 
358 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  35.2 
 
 
501 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  32.99 
 
 
337 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  33.58 
 
 
291 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  32.07 
 
 
375 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  34.94 
 
 
291 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  31.03 
 
 
355 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  31.38 
 
 
375 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  33.21 
 
 
288 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  32.67 
 
 
368 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  38.63 
 
 
377 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  34.39 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  32.01 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  32.01 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  32.01 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  32.89 
 
 
352 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  38.82 
 
 
386 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  32.13 
 
 
368 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
368 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
365 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  31.35 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
484 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  31.02 
 
 
368 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  33.09 
 
 
484 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  33.09 
 
 
484 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
484 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
641 aa  142  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
484 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.79 
 
 
484 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  29.77 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05740  signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
571 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  29.94 
 
 
340 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  32.34 
 
 
486 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  34.53 
 
 
226 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
613 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.1 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
599 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  34.65 
 
 
337 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  34.25 
 
 
337 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
2783 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
475 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  34.65 
 
 
337 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  34.65 
 
 
340 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  34.65 
 
 
314 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
637 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
723 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
639 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  29.11 
 
 
389 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  34.25 
 
 
340 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
584 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
639 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 
1131 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
3470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.32 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
639 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  33.89 
 
 
351 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
614 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
462 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
611 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
458 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
597 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  30.92 
 
 
603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>