More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3517 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
407 aa  825    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  42.86 
 
 
368 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
368 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
368 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
368 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  41.23 
 
 
368 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  40.91 
 
 
368 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  41.12 
 
 
368 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  39.8 
 
 
355 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  39.8 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
375 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  42.21 
 
 
365 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  42.53 
 
 
368 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  41.88 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  40.35 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  40.39 
 
 
385 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  39.74 
 
 
385 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  37.32 
 
 
291 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  39.41 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  38.25 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  39.34 
 
 
385 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
384 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  40.47 
 
 
501 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  40.33 
 
 
481 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  40.33 
 
 
502 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
459 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  35.08 
 
 
362 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
468 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
469 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  40 
 
 
501 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  40 
 
 
501 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  40 
 
 
501 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
480 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  36 
 
 
502 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  39.13 
 
 
501 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  39.33 
 
 
501 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  35.39 
 
 
386 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  37.93 
 
 
358 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  36.75 
 
 
377 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
381 aa  190  5e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  37.89 
 
 
360 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  36.13 
 
 
486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
340 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
361 aa  177  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
639 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
639 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
639 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
382 aa  172  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
358 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
331 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  38.74 
 
 
226 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
484 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
484 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  30.54 
 
 
352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  31.99 
 
 
340 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
359 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
641 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  32.19 
 
 
337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  35.16 
 
 
484 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  31.31 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  31.31 
 
 
337 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  31.07 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
473 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  31.06 
 
 
337 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
470 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.93 
 
 
456 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
463 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  29.35 
 
 
516 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  34.31 
 
 
583 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  28.22 
 
 
480 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  34.64 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.12 
 
 
463 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.81 
 
 
463 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
383 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  33.12 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
338 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  31.27 
 
 
354 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  26.56 
 
 
423 aa  152  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  30.64 
 
 
389 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  32.24 
 
 
694 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
382 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.52 
 
 
462 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
371 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>