More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2358 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2673  putative sensor histidine kinase  98.11 
 
 		 583 aa  1146    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.702656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2358  sensor histidine kinase  100 
 
 		 583 aa  1166    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1337  histidine kinase  41.58 
 
 		 694 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0449  sensor histidine kinase  40.75 
 
 		 743 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2939  histidine kinase  41.64 
 
 		 739 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0460  sensor histidine kinase  40.29 
 
 		 743 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.467974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 844 aa  226  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 679 aa  225  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000129021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  36.24 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 468 aa  165  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  35.2 
 
 		 502 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  34.78 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  34.74 
 
 		 481 aa  161  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  29.5 
 
 		 375 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 407 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  29.19 
 
 		 355 aa  156  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  29.2 
 
 		 375 aa  156  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2525  sensor histidine kinase  35.91 
 
 		 385 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0246  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 501 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  33.21 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 351 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0323  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000371797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2797  sensor histidine kinase  35.91 
 
 		 385 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0295  sensor histidine kinase  36.03 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2372  histidine kinase  35.52 
 
 		 385 aa  151  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0427484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 480 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0243  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 501 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 384 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 351 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  30.43 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0257  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.11256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  35.02 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0272  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 501 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 459 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 385 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5020  sensor histidine kinase  34.81 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.127373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  31.83 
 
 		 347 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4604  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 368 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.1143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 357 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  31.9 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 331 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  32.38 
 
 		 357 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  35.14 
 
 		 362 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  31.44 
 
 		 337 aa  144  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2022  two-component sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 358 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4744  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4582  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.24147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5105  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 368 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  32.65 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3168  sensory transduction protein kinase  35.11 
 
 		 486 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  32.06 
 
 		 291 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 361 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  33.21 
 
 		 291 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  31.99 
 
 		 368 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 381 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0120  Signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 885 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4962  sensor histidine kinase  32.47 
 
 		 365 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2314  histidine kinase  33.59 
 
 		 360 aa  133  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0265  histidine kinase  28.96 
 
 		 337 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.649739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4979  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0258  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0890457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 253 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.87 
 
 		 457 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 979 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1741  sensor histidine kinase, C-terminus  32.3 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.167478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.77 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.62 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 340 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1734  Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 381 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.6 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  34.57 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 484 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  33.05 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  27.59 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 463 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  26.97 
 
 		 356 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 582 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  32 
 
 		 560 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0489  histidine kinase  27 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 484 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 484 aa  124  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>